Существующая структура производства, поставок и переработки сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия в Санкт-Петербурге в последние годы устойчиво обеспечивает потребности населения Санкт-Петербурга в важнейших видах продовольствия. Вместе с тем в Санкт-Петербурге в этой сфере имеется немало проблем:
зависимость рынка сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия в Санкт-Петербурге от поставок сельскохозяйственной продукции из других регионов Российской Федерации и зарубежных стран;
высокая доля транспортной составляющей в стоимости сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия в связи с большой удаленностью Санкт-Петербурга от основных сельскохозяйственных регионов Российской Федерации и зарубежных стран;
высокий физический и моральный износ оборудования части предприятий Санкт-Петербурга, осуществляющих переработку сельскохозяйственной продукции и производство продуктов питания;
низкие темпы технологической модернизации и обновления основных производственных фондов пищевых и перерабатывающих предприятий Санкт-Петербурга;
высокая степень монополизации в ряде секторов рынка сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия в Санкт-Петербурге.