Республика Алтай характеризуется низкой транспортной связанностью с остальными территориями Российской Федерации из-за отсутствия постоянного железнодорожного сообщения, низким уровнем развития сети автомобильных дорог, связывающих Республику Алтай с соседними субъектами Российской Федерации, а также недостаточной мощностью аэропорта г.Горно-Алтайска (около 80-90 тыс. пассажиров за год), ограниченной географией совершаемых рейсов из аэропорта г.Горно-Алтайска (гг.Москва, Екатеринбург, Новосибирск, Красноярск) и низкой доступностью авиабилетов (средняя цена авиабилетов составляет около 10-12 тыс. рублей).
Территория Республики Алтай характеризуется низкой транспортной освоенностью и низким качеством автодорожного полотна. Плотность автомобильных дорог общего пользования на 1000 кв. километров в 1,3 раза меньше среднероссийского показателя и составляет 49 километров на 1000 кв. километров (65-е место по России). Несмотря на то, что удельный вес автомобильных дорог общего пользования с твердым покрытием соответствует среднероссийскому показателю (73 процента в Республике Алтай, 70 процентов - в среднем по России), доля дорог с усовершенствованным покрытием (в том числе асфальтобетонным покрытием) не превышает 35 процентов, что в 1,8 раза меньше среднероссийского показателя (81-е место по России).
Низкая транспортная доступность, низкий уровень развития транспортной инфраструктуры и высокие транспортные тарифы являются причинами:
низких темпов развития туристско-рекреационного комплекса;
высокой доли транспортных издержек в структуре себестоимости производимой продукции в Республике Алтай, что существенным образом снижает ее конкурентоспособность;
низкой транспортной подвижности населения.