Управление здравоохранением области осуществляется департаментом здравоохранения и социальной защиты населения Белгородской области.
По состоянию на 1 января 2019 года в области функционировало 69 медицинских организаций (юридические лица). В 2018 году в составе медицинских организаций области с целью оптимизации сети произошло объединение городских больниц города Старый Оскол и центральной районной больницы в одно юридическое лицо, взрослых городских больниц города Белгорода, взрослых амбулаторно-поликлинических учреждений города Белгорода, детские медицинские организации города Белгорода были присоединены к ОГБУЗ "Детская областная клиническая больница", все фтизиатрические учреждения области были присоединены к ОГКУЗ "Противотуберкулезный диспансер", создан ОГКУЗ "Центр крови" путем объединения всех станций переливания крови. Кроме того, в рамках реализации проекта "Управление здоровьем" были открыты новые центры врача общей практики (семейной медицины).
В 2018 году стационарную помощь населению оказывали 53 медицинские организации (в 2017 году - 62). В их числе 2 многопрофильные областные больницы (в том числе 1 детская), 1 окружная больница, госпиталь для ветеранов войн, 5 специализированных больниц, 6 диспансеров, 2 городские больницы, 20 центральных районных больниц, 3 районных больницы, 10 участковых больниц, входящих в состав центральных районных больниц и 3 дома сестринского ухода. Количество амбулаторно-поликлинических учреждений в 2018 году составило 292 единицы.
В число самостоятельных амбулаторно-поликлинических учреждений входят: областной центр профилактики и борьбы со СПИД, 2 центра медицинской профилактики (в том числе 1 областной), 2 многопрофильные поликлиники (в том числе 2 детские), 7 стоматологических поликлиник (в том числе 2 детские).
Структура амбулаторно-поликлинических учреждений, входящих в состав юридических лиц, включает 50 поликлиник, 40 врачебных амбулаторий и 191 центр врача общей практики (семейной медицины). Кроме того, медицинскую помощь населению оказывали специалисты 423 фельдшерско-акушерских пунктов, 16 фельдшерских здравпунктов и 1 врачебного здравпункта.
В области функционируют Центр крови, 3 станции и 38 отделений скорой медицинской помощи. Лечебно-оздоровительную работу ведут 4 детских санатория и ОГАУЗ "Санаторий "Красиво".
С целью оказания первой помощи в малочисленных (до 100 жителей) селах и хуторах организовано 41 домовое хозяйство.
Сформирована и стабильно функционирует трехуровневая система оказания медицинской помощи (рисунок 7).