Структуру органов местного самоуправления городского округа "Город Йошкар-Ола" составляют:
- представительный орган - Собрание депутатов городского округа "Город Йошкар-Ола" (далее - городское Собрание);
- высшее должностное лицо - глава городского округа "Город Йошкар-Ола", исполняющий полномочия председателя Собрания депутатов (далее - глава городского округа "Город Йошкар-Ола");
- исполнительно-распорядительный орган - администрация городского округа "Город Йошкар-Ола".