Основными задачами Комитета являются:
2.1. Участие в реализации федеральных мероприятий на территории Республики Крым в соответствии с Законом Российской Федерации от 14 мая 1993 года N 4979-1 "О ветеринарии".
2.2. Организация проведения на территории Республики Крым мероприятий по предупреждению и ликвидации болезней животных и их лечению.
2.3. Реализация федеральных, разработка и реализация республиканских целевых программ.
2.4. Защита населения от болезней, общих для человека и животных, за исключением вопросов, решение которых отнесено к ведению Российской Федерации.
2.5. Осуществление полномочий в области обращения с животными, предусмотренных законодательством в области обращения с животными.