Комитет в соответствии с поставленными перед ним задачами осуществляет следующие функции:
3.1. Проводит свою деятельность во взаимодействии с органами государственной власти Республики Крым, федеральными органами исполнительной власти, их территориальными органами и органами местного самоуправления муниципальных образований, общественными объединениями и иными организациями.
3.2. Участвует в разработке проектов законов и иных нормативных правовых актов Республики Крым в области ветеринарии.
3.3. Издает распорядительные документы по вопросам, входящим в его компетенцию, являющиеся обязательными для исполнения ветеринарными службами всех хозяйствующих субъектов независимо от их подчиненности и форм собственности, а также ветеринарными специалистами на территории Республики Крым.
3.4. Дает обязательные для исполнения всеми лицами (юридическими и физическими) указания об убое или уничтожении животных в случае заболевания в соответствии с ветеринарным законодательством Российской Федерации и Республики Крым.
3.5. Ведет ветеринарную статистику, связанную с заболеваниями животных.
3.6. Осуществляет регистрацию специалистов в области ветеринарии, не являющихся уполномоченными лицами органов и организаций, входящих в систему Государственной ветеринарной службы Российской Федерации, занимающихся предпринимательской деятельностью в области ветеринарии.
3.7. Формирует и утверждает государственные задания по оказанию государственных услуг (работ) для подведомственных государственных бюджетных учреждений.
3.8. Осуществляет организационно-техническое обеспечение деятельности координационных и совещательных органов (советов, комиссий), в том числе межведомственных, по вопросам, входящим в сферу деятельности Комитета.
3.9. Ведет учет ветеринарных кадров, обеспечивает повышение квалификации и переподготовку ветеринарных работников государственной ветеринарной службы Республики Крым.
3.10. Осуществляет полномочия Российской Федерации в области ветеринарии, переданные для осуществления органам государственной власти Республики Крым:
3.10.1. по установлению ограничительных мероприятий (карантина) на территории Республики Крым;
3.10.2. по отмене ограничительных мероприятий (карантина) на территории Республики Крым.
3.11. Осуществляет своевременное представление в федеральный орган исполнительной власти в области нормативно-правового регулирования в ветеринарии: