Современная экологическая ситуация в Республике Саха (Якутия) обусловлена, с одной стороны, наличием обширных малонаселенных, не затронутых хозяйственной деятельностью районов (свыше 90% территории республики не затронуты промышленным или иными видами освоения), с другой стороны - высоким уровнем антропогенного воздействия добывающих предприятий на локальных территориях в промышленных районах (Алданском, Верхоянском, Ленском, Мирнинском, Нерюнгринском, Оймяконском, Усть-Майском) и потенциальными рисками объектов накопленного вреда окружающей среде в Алданском, Верхоянском и Усть-Янском районах.
По сведениям Управления Росприроднадзора по Республике Саха (Якутия) выбросы загрязняющих веществ в атмосферу, отходящих от 12 923 стационарных источников (в 2017 г. - 15 936), составили 256,27 тыс. т, что на 12,66 тыс. т больше, чем в 2017 г., что не превышает уровня 2016 г. Уловлено 378,336 тыс. т загрязняющих веществ, что составило 59,6% от общего количества отходящих загрязняющих веществ, из них утилизировано 10,708 тыс. т.
Основными веществами, загрязняющими атмосферный воздух от стационарных источников загрязнения, являются оксид углерода - 138,357 тыс. т (54%), твердые вещества - 46,485 тыс. т (18,1%), углеводороды, включая летучие органические соединения - 30,815 (12%), оксиды азота - 29,530 тыс. т (11,5%), диоксид серы - 10,819 тыс. т (4,2%).
По результатам наблюдений ФГБУ "Якутское УГМС" на территории населенных пунктов республики с 2006 г. не фиксировалось случаев экстремально высокого загрязнения атмосферного воздуха (превышение максимально разовых предельно допустимых концентраций в 50 раз), с 2012 г. не фиксируются случаи высокого загрязнения (выше 10 ПДК). В 2018 г. уровень загрязнения атмосферного воздуха в г. Мирном, г. Нерюнгри характеризуется как низкий, в г. Якутске - повышенный.
Радиационная обстановка на территории Республики Саха (Якутия) в 2018 г. оценивается как удовлетворительная, радиационных аварий и превышений гигиенических нормативов по радиоактивному загрязнению окружающей среды не зарегистрировано.
По территории Якутии протекает свыше 700 тыс. рек и малых водотоков общей протяженностью 1,9 млн. км, около 825 тыс. озер суммарной площадью более 83 тыс. кв. км. Республика Саха (Якутия) по своим природным условиям относится к регионам с высокой вероятностью наводнений, угроза которых существует почти для всех населенных пунктов, расположенных на реках. Катастрофические наводнения в бассейнах рек Лены, Колымы, Алдана и Амги, и малых реках Республики Саха (Якутия) происходят с устойчивой частотой. На сегодняшний день в республике имеются 64 населенных пункта, остро нуждающихся в строительстве объектов инженерной защиты и берегоукрепления.
По данным ФГБУ "Якутское УГМС" в 2018 г. качественный состав поверхностных вод рек Лена, Яна оценивается как "грязные" (4-й класс разряда "а"), реки Алдан, Вилюй, Индигирка, Колыма, Анабар - "очень загрязненные" (3-й класс разряда "б"), река Оленек - "загрязненная" (3-й класс разряда "а").
Особого внимания требует проблема негативного антропогенного воздействия на водные объекты. В 2018 г. сброс сточных вод в поверхностные водные объекты составил 154,1 млн. м3, увеличившись по сравнению с предыдущим годом на 31,13 млн. м3 (125,3%). По структуре сточных вод, по степени загрязнения недостаточно очищенные составляют 34% (52,39 млн. м3), нормативно чистые (без очистки) воды - 51,8% (79,81 млн. м3), загрязненные без очистки - 2,9% (4,41 млн. м3), нормативно очищенные - 11,3% (17,49 млн. м3).
Так, 89 из 94 временных очистных сооружений объектов золото- и алмазодобычи, представляющих собой отстойные водоемы, не обеспечивают нормативную очистку сточных вод. Подавляющее большинство из 28 эксплуатируемых в населенных пунктах очистных сооружений в силу физического износа, проектных недоработок, перегрузки по объему сточных вод не обеспечивают очистку до установленных нормативов. Большинство из них построены в 30 - 40-х годах прошлого века и требуют капитального ремонта и модернизации.
В 2018 г. в Республике Саха (Якутия) объем образования отходов всех классов опасности составил 427 млн. тонн. Более 99% образовавшихся отходов представлены отходами 5 класса опасности, которые образуются в результате деятельности добывающей промышленности: вскрышные породы, отходы породы при обогащении угольного сырья, отходы промывки песков при золотодобыче и алмазодобыче, отвалы и золошлаки.
С 1 января 2019 г. регион перешел на новую систему обращения с твердыми коммунальными отходами (далее - ТКО). Республика поделена на 5 зон деятельности региональных операторов: Южная зона - МУП "Переработчик"; Западная зона - ООО "Мирнинское предприятие жилищного хозяйства"; Центральная зона - ООО "Якутскэкосети"; Центрально-восточная зона - ООО "Экологические системы Якутии"; Арктически-северная зона - ГУП "Жилищно-коммунальное хозяйство Республики Саха (Якутия)". С начала 2019 г. операторами по транспортированию отходов вывезено более 1 млн. м3 ТКО. На сегодня в республике эксплуатируется 471 объект размещения отходов, в том числе 415 полигонов и свалок: 15 полигонов, построенных по типовым проектам (г. Якутск, Мирный, Алдан, Ленск, Нерюнгри), на остальных территориях функционируют санкционированные свалки. Из действующих объектов размещения отходов в Государственном реестре объектов размещения отходов зарегистрировано всего 17 объектов, из них 7 муниципальных.
Одной из экологических проблем Республики Саха (Якутия) является проблема ликвидации нанесенного вреда окружающей среде и нарушенных земель. По данным Управления Росприроднадзора по Республике Саха (Якутия) общая площадь нарушенных земель в Республике Саха (Якутия) на начало 2018 г. составила 50,4 тыс. га. В структуре нарушенных земель преобладают земли, нарушенные при добыче полезных ископаемых открытым способом, занятые отвалами вскрышных пород, золо- и шлакоотвалами, подъездными дорогами и промышленными площадками. На землях населенных пунктов к нарушенным землям отнесены земельные участки, образованные в процессе производства строительных работ и добычи строительных материалов. Экологическую опасность представляют объекты накопленного вреда окружающей среде, в том числе хвостохранилища ликвидированных горнодобывающих предприятий (хвостохранилища Депутатского ГОК, Куларской, Лебединской ЗИФ и Батагайской ОФ), объекты накопления лома цветного и черного металла, заброшенные населенные пункты, бесхозные скважины, оставшиеся в результате ранее проведенных геолого-разведочных работ, затонувшие суда и др.
Лесной фонд на территории Республики Саха (Якутия) занимает 254,7 млн. га, что составляет 82% от общей площади республики, в том числе покрытые лесной растительностью земли составляют 155,5 млн. га, непокрытые лесной растительностью земли составляют 41,2 млн. га, нелесные земли 58 млн. га. Общая площадь земель лесного фонда за период 2018 г. уменьшилась на 185,2846 га за счет перевода категории земель лесного фонда в земли промышленности и иного специального назначения в целях строительства и реконструкции автомобильных дорог.
По целевому назначению леса подразделяются: защитные леса - 32,9 млн. га или 13% от всей площади лесов, эксплуатационные леса - 95,0 млн. га (37%), резервные леса - 126,8 млн. га (50%). Общий запас древесины составляет 8,7 млрд. м3. Расчетная лесосека (ежегодный допустимый объем изъятия древесины) составляет 36,7 млн. м3 в год.