4.1. Министерство возглавляет министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Главой Республики Башкортостан по представлению Премьер-министра Правительства Республики Башкортостан.
Министр имеет заместителей, в том числе одного первого заместителя, назначаемых на должность и освобождаемых от должности Правительством Республики Башкортостан в порядке, определяемом Главой Республики Башкортостан. В случае временного отсутствия министра его обязанности исполняет первый заместитель министра.
Министр несет ответственность за невыполнение или ненадлежащее выполнение функций и полномочий, возложенных на Министерство, в том числе за недостижение плановых значений показателей для оценки эффективности деятельности Министерства в установленном порядке.
4.2. Министр:
4.2.1. Руководит деятельностью Министерства, распределяет обязанности среди своих заместителей, утверждает (согласовывает) положения о структурных подразделениях Министерства, а также в установленном порядке положения (уставы) об организациях, находящихся в ведении Министерства, определяет компетенцию должностных лиц Министерства в решении функциональных, организационных, кадровых, финансовых, производственно-хозяйственных и иных вопросов.
4.2.2. Вносит в установленном порядке на рассмотрение в Правительство Республики Башкортостан проекты нормативных правовых актов по вопросам, входящим в компетенцию Министерства.
4.2.3. Издает нормативные правовые акты в форме приказов, а в случаях, предусмотренных законодательством, - в форме постановлений. Дает указания по вопросам деятельности аппарата Министерства, организаций, находящихся в ведении Министерства.
4.2.4. Представляет Министерство во взаимоотношениях с органами государственной власти Российской Федерации, органами государственной власти субъектов Российской Федерации, органами государственной власти субъектов иностранных государств, административно-территориальных образований иностранных государств, а также международными организациями.
4.2.5. Утверждает структуру и штатное расписание Министерства в пределах установленной предельной численности и фонда оплаты труда.
4.2.6. В пределах компетенции Министерства назначает на должность и освобождает от должности работников Министерства и руководителей организаций, находящихся в ведении Министерства.
4.2.7. Утверждает положение о материальном стимулировании работников Министерства.
4.2.8. Принимает решения о поощрении работников Министерства и наложении на них взысканий.
4.2.9. Представляет в установленном порядке особо отличившихся работников Министерства к награждению государственными наградами.
4.2.10. Утверждает смету расходов на содержание аппарата Министерства.