Основными функциями СЭД являются:
2.1. Построение целостной информационной инфраструктуры, охватывающей Правительство Сахалинской области, органы исполнительной власти Сахалинской области, а также подведомственные им учреждения для организации эффективного электронного документооборота с учетом возможностей информационных и коммуникационных технологий.
2.2. Автоматизация управления документами, включая процессы их создания, согласования, утверждения, контроля исполнения поручений, обработки, передачи и хранения в Правительстве Сахалинской области, органах исполнительной власти Сахалинской области, а также подведомственных им учреждениях.