5.1. Охрана ресурсного резервата "Бэкэ" осуществляется должностными лицами уполномоченного природоохранного учреждения Республики Саха (Якутия).
5.2. Государственный надзор в области охраны и использования особо охраняемых природных территорий и государственный экологический надзор на особо охраняемых природных территориях осуществляется в порядке, установленном федеральным законодательством.
5.3. Охрана территории ресурсного резервата "Бэкэ" осуществляется путем выставления постов (кордонов) и патрулирования с использованием наземного, водного и воздушного транспорта.