Основными функциями Министерства являются:
3.1. Организация работы по обеспечению уважительных межэтнических и межконфессиональных отношений в обществе для сохранения мира, согласия и стабильности в Карачаево-Черкесской Республике и Российской Федерации.
3.2. Изучение, анализ, прогноз состояния и развития межэтнических отношений и религиозной ситуации в республике, их влияния на развитие социально-экономических, политических, организационно-правовых и иных отношений в обществе, информирование Главы Карачаево-Черкесской Республики о состоянии межэтнических отношений и религиозной обстановки в республике, тенденциях их развития, возможных осложнениях, внесение на рассмотрение в установленном порядке предложений организационного, экономического или иного характера, осуществление которых способно стабилизировать ситуацию в республике.
3.3. Подготовка проектов нормативных правовых актов по вопросам, отнесенным к компетенции Министерства.
3.4. Координация деятельности органов исполнительной власти республики по вопросам, относящимся к компетенции Министерства, взаимодействие с органами местного самоуправления в сфере межэтнических и государственно-конфессиональных отношений, печати и средств массовой информации.
3.5. Взаимодействие с федеральными органами государственной власти и их территориальными органами, органами государственной власти Карачаево-Черкесской Республики и органами государственной власти иных субъектов Российской Федерации, органами местного самоуправления республики, религиозными и общественными объединениями, предприятиями, учреждениями и организациями различных форм собственности.
3.6. Оказание гражданам бесплатной юридической помощи в виде правового консультирования в устной и письменной форме по вопросам, относящимся к компетенции Министерства, в порядке, установленном законодательством Российской Федерации и Карачаево-Черкесской Республики для рассмотрения обращений граждан.
3.7. Координация деятельности подведомственных государственных учреждений.
3.8. Организация контроля в пределах предоставленных полномочий за соблюдением законодательства о печати и средствах массовой информации на территории Карачаево-Черкесской Республики.
3.9. Подготовка предложений по урегулированию вопросов, связанных с деятельностью общественных и религиозных организаций и требующих решений Главы Карачаево-Черкесской Республики, Правительства Карачаево-Черкесской Республики, органов исполнительной власти республики.
3.10. Накопление банка данных по действующим на территории Карачаево-Черкесской Республики религиозным и общественным объединениям, учреждениям и организациям.
3.11. Информирование населения республики через средства массовой информации о важнейших событиях общественной и религиозной жизни.
3.12. Анализ содержания материалов печатных и электронных средств массовой информации и выработка методических и практических рекомендаций по улучшению их деятельности.
3.13. Разработка номенклатуры дел, ведение учета и контроля за исполнением входящей документации.