В соответствии с возложенными на него задачами Совет осуществляет следующие функции:
3.1. Осуществляет подготовку предложений по вопросам:
состояния и проблем реализации конституционных прав и свобод человека и гражданина;
взаимодействия с общественными объединениями и иными институтами гражданского общества по вопросам обеспечения и защиты прав и свобод человека и гражданина, развития институтов гражданского общества.
3.2. Осуществляет подготовку предложений к ежегодным посланиям Главы Республики Башкортостан Государственному Собранию - Курултаю Республики Башкортостан по вопросам, относящимся к компетенции Совета.
3.3. Подготавливает и размещает на сайте Главы Республики Башкортостан ежегодный доклад по вопросам обеспечения и защиты прав и свобод человека и гражданина, развития институтов гражданского общества.
3.4. Осуществляет мониторинг поступающих от граждан, общественных объединений или опубликованных в средствах массовой информации сообщений о фактах нарушений закона, ущемлении прав граждан, а также проверку указанных сообщений и принятие мер в рамках полномочий Совета.
3.5. Разрабатывает рекомендации для государственных органов Республики Башкортостан, органов местного самоуправления Республики Башкортостан по вопросам, относящимся к компетенции Совета.
3.6. Рассматривает обращения граждан, юридических лиц, содержащих информацию о проблемах в области обеспечения и защиты прав и свобод человека и гражданина, развития институтов гражданского общества.
Совет не рассматривает обращения по личным вопросам, в том числе связанные с имущественными, жилищными и трудовыми спорами, а также с жалобами на решения судов, органов следствия и дознания.
3.7. Участвует в организации семинаров, научно-практических конференций, симпозиумов в установленной сфере деятельности.
3.8. Принимает участие в разработке, подготовке и публикации методических, справочных и информационно-аналитических материалов по вопросам, входящим в компетенцию Совета.
3.9. Оказывает содействие средствам массовой информации в освещении работы по защите прав и свобод человека и гражданина.