Рельеф широкоувалистый с переходом в холмистый, покрытый густой эрозионной сетью, - глубокими падями и распадками, оврагами.
Климат района суровый. Среднегодовая температура воздуха до -1,3° C. Среднемесячная температура января - -27,2° C, июльская - +21,2° C. Среднегодовое количество осадков - 560 - 620 мм. Средняя высота снежного покрова - 17 см. Продолжительность залегания - до 140 дней.
Гидрографическая сеть включает ручей Чернушка и небольшие озера.
Почвы луговые глеевые и лугово-черноземовидные в комплексе с глеевыми.
Заказник "Харьковский" расположен в безлесном Зейско-Буреинском районе на месте бывших смешанных лесов и лугов. Леса сохранились по широким водоразделам. Встречаются белоберезники, осинники, заросли из дубняка, черноберезника, леспедецы и лещины разнолистной.
Значительные пространства заняты злаково-разнотравными, осоково-вейниковыми с разнотравьем и вейниково-осоковыми лугами и травяными болотами.
Животный мир слагают представители лесо-лугового комплекса, тесно связанные с открытыми луговыми пространствами и ландшафтами лесостепного типа с присутствием таежных, степных видов и видов, обитающих в широколиственных лесах.