Рельеф представлен горами средней высоты с плоскими вершинами высотой 500 - 700 м над уровнем моря. Самая высокая точка - г. Куранга (1093 м). Территория расчленена горными ручьями и речками с узкими, каменистыми долинами.
Климат континентальный с чертами муссонного. Среднегодовая температура воздуха - -3,9°, среднемесячная температура января - -33° C, июля - +16,8° C. Средняя высота снегового покрова - до 45 см, продолжительность залегания - до 196 дней. Среднегодовое количество осадков - 650 - 700 мм. Влажность воздуха изменяется в пределах 65 - 85%.
Гидрографическая сеть представлена реками Селемджа, Большая Эльга, Большой Каракын, Синиткан, Бага, Гербикаган, Гербикан, Сагир и многочисленными безымянными ключами. В долине Гербикана немногочисленные озера пойменного типа.
Почвы горные буро-таежные иллювиально-гумусовые оподзоленные, сформировавшиеся на многолетнемерзлых горных породах.
Заказник "Гербиканский" расположен в зоне хвойных лесов, подзоне средней тайги. Преобладают таежные леса восточносибирского типа с лиственницей, сосной и березой плосколистной. Распространены багульниковые и сфагновые лиственничники.
Луга приурочены преимущественно к узким прирусловым полосам пойм рек и ключей, образованы в сочетании с влаголюбивыми осоками и разнотравьем.
Животный мир слагают представители восточносибирского фаунистического комплекса, в который с юга вливаются виды, относящиеся к маньчжурской и степной фауне. С востока проникают представители охотской фауны темнохвойной тайги.