Финансирование деятельности Регионального модельного центра осуществляется в соответствии с требованиями бюджетного законодательства Российской Федерации за счет средств бюджета Амурской области и средств субсидии из федерального бюджета, полученных бюджетом Амурской области на поддержку реализации мероприятий по формированию современных управленческих и организационно-экономических механизмов в системе дополнительного образования детей в рамках федерального проекта.