Использование лесов для научно-исследовательской и образовательной деятельности осуществляется в соответствии со статьей 40 Лесного кодекса Российской Федерации и Правилами использования лесов для осуществления научно-исследовательской деятельности, образовательной деятельности, утвержденными приказом Министерства природных ресурсов и экологии Российской Федерации от 27 июля 2020 г. N 487 (далее - Правила использования лесов для осуществления научно-исследовательской деятельности, образовательной деятельности).
(в ред. Указа Главы Республики Алтай, Председателя Правительства Республики Алтай от 30.05.2022 N 150-у)
Леса для осуществления научно-исследовательской деятельности, образовательной деятельности могут использоваться только научными организациями, образовательными учреждениями.
В научно-исследовательской и образовательной деятельности используются территории особо охраняемых территорий, часть лесного фонда Турочакского, Чойского, Усть-Коксинского, Шебалинского лесничеств.
Заповедники являются природоохранными, научно-исследовательскими и эколого-просветительскими учреждениями федерального значения, имеющими целью сохранение и изучение естественного хода природных процессов и явлений, генетического фонда растительного и животного мира, отдельных видов и сообществ растений и животных, типичных и уникальных экологических систем Горного Алтая.
В 2010 году на базе Алтайского государственного природного биосферного заповедника в рамках научного сотрудничества проведено 8 комплексных научных экспедиций сторонних научно-исследовательских организаций, в которых приняли участие 75 научных сотрудников.
В 1975 году под руководством сотрудников НИИЛГиС (проф. Титов Е.В.):
в кв. 31 выд. 2 Саракокшинского участкового лесничества Чойского лесничества на площади 1,4 га заложены архивы клонов плюсовых деревьев кедра (прививочные плантации);
на Уйменском перевале на площади 67 га созданы высокопродуктивные эталонные для Сибири лесные культуры кедра сибирского со статусом генетического резервата;
в районе села Уймень основан научный стационар по селекции сосны кедровой сибирской ("Кедроград"), где ведется работа по созданию постоянной лесосеменной базы сосны кедровой сибирской на генетико-селекционной основе;
в Пыжинском участковом лесничестве Турочакского лесничества в квартале 10 выделы: 4, 5, 32 на площади 12,3 га заложены архивы клонов плюсовых деревьев кедра (прививочные плантации), в кварталах 10, 12 выделы: 4, 5, 19, 22 на площади 45,23 га заложены лесосеменные плантации кедра.
Разработаны научные основы селекции данной породы на семенную продуктивность, рекомендации по отбору плюсовых деревьев. Рекомендации имеют большое значение для эффективного использования ценного генофонда кедра сибирского на основе генетико-селекционной оценки клонов плюсовых деревьев. Разработаны рекомендации по созданию высокоурожайных плантаций и выделению сортов клонов кедра сибирского. Рекомендации представляют большую практическую ценность. Они основаны на изучении 24-летнего клонового потомства плюсовых деревьев, доступны для освоения и использования работниками лесного хозяйства. На их основе выделены три сорта-клона по семенной продуктивности. "Рекомендации по выделению сортов-клонов у сосны кедровой сибирской и кандидатов в сорта-клоны по семенной продуктивности" являются результатом 30-летней работы профессора Е.В.Титова по созданию селекционной базы кедра в Республике Алтай.
В Турочакском и Чойском лесничествах Институтом водных и экологических проблем СО РАН (г. Барнаул) ведутся исследования по возобновительному процессу темнохвойных пород, целесообразности создания кедровых плантаций, по противопожарному обустройству лесов. В кварталах 36, 37, 43, 48, 62, 64, 69, 170, 172 Иогачского участкового лесничества Турочакского лесничества заложено 50 временных пробных площадей, а в кварталах 95, 128 - пять постоянных пробных площадей для изучения хода естественного возобновления.
В Шебалинском лесничестве ведутся работы по созданию ботанического сада с целью интенсификации научно-исследовательских работ в области ботаники, интродукции и акклиматизации растений в особых условиях горных территорий, сохранения генетического многообразия, пропаганды экологических и ботанических знаний.