Селекция и семеноводство играют ключевую роль в обеспечении повышения урожайности зерновых и зернобобовых культур и устойчивости их к негативным воздействиям внешних факторов. В Российской Федерации вклад селекции в повышение урожайности за последние десятилетия оценивается в 30-70 процентов и по мере усиления негативных тенденций климатических изменений ее роль будет увеличиваться.
Материально-техническая база большинства научных организаций, занимающихся селекцией и семеноводством, устарела и имеет высокую степень износа. Усиливается дефицит научных кадров, так как низкий уровень оплаты труда и недостаточный престиж большинства профессий в сельскохозяйственной отрасли приводят к тому, что существующий приток молодых специалистов недостаточен для обеспечения преемственности научных исследований и подготовки кадров.
Одна из основных проблем подотрасли - слабое развитие рынка семян сельскохозяйственных растений, что обусловлено преобладанием внутрихозяйственного семеноводства, при этом до 30 процентов высеваемых семян относится к категории массовых репродукций. Товарность семеноводства составляет около 10 процентов от высеваемых семян (исключение - рынок семян кукурузы).
Низкая товарность семян обусловлена также неоптимальным соотношением цены и качества, так как реализуемая продукция не имеет значительных преимуществ перед семенами, производимыми внутри хозяйств сельскохозяйственных товаропроизводителей. Имеются семеноводческие хозяйства, использующие устаревшую материально-техническую базу, технологии посевных работ часто не соблюдаются, что приводит к снижению качества семян, связанному в первую очередь с высоким уровнем засоренности.
В объеме семян зерновых и зернобобовых, включая кукурузу, использованных для высева в 2018 году, доля семян отечественной селекции составила около 78 процентов.