Государственная программа состоит из четырех подпрограмм, в комплексе обеспечивающих достижение поставленной цели и решение программных задач. Для каждой подпрограммы сформулированы цель, задачи, целевые индикаторы и их прогнозные значения, перечень мероприятий, за счет реализации которых предполагается достичь намеченных результатов.
В 2012-2013 годах Государственная программа имела иную структуру и состояла из четырех подпрограмм, соответствующих уровням образования, и одной подпрограммы, мероприятия которой были направлены на повышение качества услуг в сфере образования. Вступление в силу Федерального закона от 29 декабря 2012 г. N 273-ФЗ "Об образовании в Российской Федерации" и необходимость укрупнения подпрограмм и мероприятий в целях оптимизации расходования бюджетных средств продиктовали пересмотр структуры Государственной программы. В приложениях к Государственной программе мероприятия ранее действовавшей структуры Государственной программы приведены в сопоставимых условиях и включены в новую структуру.
Две подпрограммы охватывают уровни образования и предусматривают комплексы мер, направленных на расширение доступности, повышение качества и эффективности образовательных услуг в дошкольном, начальном общем, основном общем, среднем общем, профессиональном, высшем образовании. Третья подпрограмма объединяет направления образования, программы освоения которых не повышают уровень образования. Четвертая подпрограмма содержит комплекс действий системного характера, направленных на развитие системы образования в целом.
Подпрограммы:
- подпрограмма "Общее образование" (таблица 1 приложения 1 к Государственной программе);
- подпрограмма "Профессиональное образование" (таблица 2 приложения 1 к Государственной программе);
- подпрограмма "Дополнительное образование и профессиональное обучение" (таблица 3 приложения 1 к Государственной программе);
- подпрограмма "Развитие системы образования" (таблица 4 приложения 1 к Государственной программе).