Информационная система ОМС РО строится на использовании следующих принципов:
- Однократный ввод первичной информации - данные, необходимые для функционирования системы, должны вводиться однократно и в дальнейшем использоваться на всех этапах жизненного цикла этой информации;
- Взаимосвязанность данных, использование единых систем классификации и кодирования данных - все информационные потоки и ресурсы системы должны базироваться на единых общедоступных справочниках и классификаторах, использовании внутрисистемных уникальных идентификаторов данных с системой контроля их достоверности;
- Использование открытых систем - программные средства должны быть легко адаптируемы, обеспечивать взаимодействие между собой на основе описанных интерфейсов взаимодействия;
- Обеспечение конфиденциальности информации - учитывая наличие в используемых данных персональных сведений о гражданине и элементов врачебной тайны, программные средства должны быть оснащены средствами защиты информации от несанкционированного доступа;
- Программное обеспечение, используемое субъектами, должно удовлетворять определенным критериям по надежности подготовки и хранения данных, скорости ее обработки и функциональности.