5.1. Министерство возглавляет министр, назначаемый на должность и освобождаемый от должности Губернатором Сахалинской области в установленном порядке.
5.2. Министр:
5.2.1. осуществляет непосредственное руководство деятельностью Министерства на принципах единоначалия;
5.2.2. несет персональную ответственность за выполнение возложенных на Министерство задач и осуществление им своих функций;
5.2.3. в соответствии с предельной численностью и фондом оплаты труда утверждает штатное расписание Министерства;
5.2.4. утверждает бюджетную роспись на содержание Министерства в пределах средств, предусмотренных в областном бюджете, а также рассматривает и утверждает планы финансово-хозяйственной деятельности и смету доходов и расходов подведомственных учреждений;
5.2.5. назначает на должности руководителей областных автономных и бюджетных государственных учреждений, заключает и расторгает с ними трудовые договоры, устанавливает им должностные оклады, стимулирующие и компенсационные выплаты в соответствии с действующим законодательством Российской Федерации и Сахалинской области;
5.2.6. действует без доверенности при представлении интересов Министерства во всех органах и организациях, включая судебные;
5.2.7. заключает в пределах бюджетных ассигнований государственные контракты (договоры), подписывает финансовые документы, обеспечивает соблюдение финансовой и учетной дисциплины;
5.2.8. осуществляет полномочия представителя нанимателя в отношении государственных гражданских служащих Министерства;
5.2.9. утверждает положения о структурных подразделениях и должностные регламенты государственных гражданских служащих Министерства;
5.2.10. решает в соответствии с законодательством о государственной гражданской службе Российской Федерации и Сахалинской области вопросы, связанные с прохождением государственной гражданской службы в Министерстве;
5.2.11. вносит в министерство финансов Сахалинской области предложения по формированию областного бюджета и финансированию подведомственных Министерству учреждений;
5.2.12. дает указания, издает приказы и распоряжения по вопросам своей компетенции, обязательные для исполнения всеми государственными гражданскими служащими Министерства, а также организует контроль за их исполнением;