Разработка стратегии проводилась с использованием совокупности научных методов (цивилизационный подход, структурно-функциональный анализ, трендовый анализ, прогнозирование, выявление и структурирование проблем, метод экспертной оценки, использование эффектов групповой работы, программно-целевой подход и другие), что позволило сделать ее научно обоснованной.
При разработке стратегии в качестве базовых представлений о городе использовалась модель "Город-корпорация", а также идеи межрегиональной и мировой интеграции, глобалистики.
Актуализация Стратегического плана развития Екатеринбурга базируется на системе контрольных показателей деятельности Администрации города Екатеринбурга и показателях эффективности реализации стратегических проектов, отражающих все сферы социально-экономического развития муниципального образования "город Екатеринбург".
Стратегический план Екатеринбурга учитывает результаты научных исследований, проводимых специалистами в области стратегического менеджмента, городского планирования и управления, охватывает практические достижения и опыт стратегического планирования, имеющийся у отечественных и зарубежных городов, в частности Санкт-Петербурга, Лиона, Бирмингема и др.