Система здравоохранения Екатеринбурга представляет собой развитую сеть федеральных, региональных, муниципальных и частных медицинских лечебно-профилактических учреждений, оснащенных современным оборудованием, позволяющим оказывать высокотехнологичную медицинскую помощь не только жителям города и области, но и пациентам других регионов России.
Ряд учреждений здравоохранения сформирован на базе научно-исследовательских институтов медицинской направленности, которые являются центрами не только городского, но и федерального значения: Федеральное государственное учреждение "Уральский научно-исследовательский институт дерматовенерологии и иммунопатологии", Федеральное государственное учреждение "Уральский научно-исследовательский институт травматологии и ортопедии им. В.Д. Чаклина", Федеральное государственное учреждение науки "Екатеринбургский научно-исследовательский институт вирусных инфекций", Федеральное государственное учреждение "Уральский научно-исследовательский институт охраны материнства и младенчества", Государственное бюджетное учреждение здравоохранения Свердловской области Научно-практический центр специализированных видов медицинской помощи "Уральский институт "Кардиология", Екатеринбургский центр межотраслевого научно-технического комплекса "Микрохирургия глаза" и другие.
В Екатеринбурге функционируют около 100 медицинских центров и клиник, работающих в области платной медицины (а также выполняющих муниципальный заказ), количество которых постоянно увеличивается. Большинство частных клиник позиционируют себя как многопрофильные центры с широким спектром услуг, что позволяет им конкурировать с государственными и муниципальными учреждениями.
Численность врачей в лечебных учреждениях в 2009 году составила 11466 человек (83,4 на 10000 человек населения), численность среднего медицинского персонала - 16856 человек (122,5 на 10000 человек населения).
Екатеринбург обладает комплексной системой подготовки медицинских кадров.
Реализация стратегических проектов и городских программ, направленных на профилактику и лечение населения при новообразованиях, артериальной гипертонии, совершенствование травматологической помощи, а также комплекс мероприятий по охране материнства и детства, способствовали в последние годы сокращению большинства социально значимых заболеваний.