Падения мировых цен на нефть может привести к дестабилизации экономики и социальной сферы в России. Реформы российской экономики провести во время кризиса будет практически невозможно. Для экономики города Якутска это означает рост рисков в привлечении инвестиций, снижение уровня покупательской способности доходов населения, что может привести к затяжному кризису, ухудшению основных показателей экономической безопасности.
Приток внутрирегиональных мигрантов, прежде всего из-за объективного характера урбанизации, а также вследствие относительного снижения доходов населения в сельской местности.
Усиление техногенного воздействия на природные комплексы. По степени экологической безопасности Якутск является одним из самых неблагополучных районов в республике. На территории городского округа сосредоточены крупные предприятия промышленного, сельскохозяйственного, жилищно-коммунального и топливно-энергетического назначения, что обуславливает высокую нагрузку на экологию, наличие разнообразных техногенных эмиссий - выбросов, стоков, тепловых и акустических полей и др. Система обезвреживания твердых бытовых отходов не соответствует современным требованиям и основана на захоронении отходов.