Болото Дзеля-Нюр, охраняемое в заказнике, отнесено к категории клюквенных болот.
По своей структуре Дзеля-Нюр - типичное верховое болото, имеющее выпуклую поверхность, на которой хорошо выделяются такие элементы, как вершина, склон и окрайка. Окрайка представлена ровными участками с отдельно стоящими деревьями сосны обыкновенной (Pinus sylvestris) и березы карликовой (Betula nana) либо кочковато-топяными комплексами. Ровные участки заняты осоково-сфагновыми сообществами, в травяно-кустарничковом ярусе которых доминируют такие виды, как осока бутыльчатая (Carex rostrata) или осока волосистоплодная (Carex lasiocarpa). Моховой покров сомкнутый, довольно однородный и образован сфагновыми мхами (сфагнум балтийский (Sphagnum balticum) и др.). Растительный покров кочковато-топяных комплексов окрайки образован кустарничково-сфагновыми фитоценозами. Здесь из кустарничков наиболее обилен подбел узколистный (Andromeda polifolia), заметное участие принадлежит роду Пушица (Eriophorum). Напочвенный покров образован смесью сфагновых и зеленых мхов (сфагнум узколистный (Sphagnum angustifolium), сфагнум магелланский (Sphagnum magellanicum), плеврозиум Шребера (Pleurozium schreberi). В пониженных участках к кустарничкам и к растениям рода Пушица (Eriophorum) присоединяются осока бедненькая (Carex irrigua) и осока плетевидная (Carex chordorrhiza).
По мере удаления от края болота происходит смена кочковато-топяных участков грядово-мочажинными комплексами. Гряды достаточно высокие и широкие, их длина варьирует от 10 до 200 м. Самыми распространенными видами растений на грядах являются подбел узколистный (Andromeda polifolia) и морошка (Rubus chamaemorus). В напочвенном покрове доминируют сфагновые мхи, иногда с примесью лишайников. В понижениях между грядами (мочажинах) преобладает шейхцерия болотная (Scheuchzeria palustris). В центральной части комплекса полосы таких мочажин становятся топкими и непроходимыми. Сходные сочетания растительных сообществ характерны и для вершины болота.
В заказнике отмечен редкий вид, внесенный в Красную книгу Республики Коми (2009), - сосна сибирская (Pinus sibirica) и вид, включенный в перечень объектов, рекомендуемых для биологического надзора, - пальчатокоренник пятнистый (Dactylorhiza maculata).