Основным топливом для ТЭЦ-1, районной котельной, котельных АО "СКК" и источников ООО "СахГЭК" является природный газ. Часть котельных АО "СКК" в качестве топлива использует керосин и бурый уголь.
ОП "Южно-Сахалинская ТЭЦ-1" ПАО "Сахалинэнерго" является одним из основных и наиболее интенсивных стационарных источников загрязнения атмосферного воздуха. Основными загрязняющими веществами являются диоксид серы, оксиды азота, оксид углерода, пыль и газообразные загрязняющие вещества.
После завершения работ по переводу Южно-Сахалинской ТЭЦ-1 на сжигание природного газа произошло кардинальное изменение топливного баланса ОАО "Сахалинэнерго". Это оказало существенное влияние на количественный и качественный состав промышленных выбросов, так как при сжигании газообразного топлива в топке котлов образуются 4 загрязняющих вещества вместо 7 при сжигании твердого топлива. Изменение топливного баланса ОАО "Сахалинэнерго" и перераспределение выработки электроэнергии с паросилового оборудования на газотурбинные установки 4-го и 5-го энергоблоков Южно-Сахалинской ТЭЦ-1 позволило снизить валовые выбросы загрязняющих веществ в атмосферу на 91%: в 2010 году - 28193,9 тонны, в 2017 году - 2648,7 тонны.