Водоснабжение города Благовещенска обеспечивают три водозабора: "Амурский", "Северный" и "Каптажный" и 5 глубоководных скважин общей производительностью 83,5 тыс. куб. м/сут.
Для стабильного водоснабжения домов повышенной этажности используются 68 муниципальных повысительных насосных станций.
Протяженность муниципальных водопроводных сетей составляет 378 км, канализационных - 279 км.
Сточные воды перекачиваются 40 канализационными насосными станциями, их очистку обеспечивают очистные сооружения производительностью 64 тыс. куб. м/сут.
Городские очистные сооружения полной биологической очистки производительностью 60 тыс. куб. м в сутки, построенные в месте впадения р. Зеи в р. Амур, перегружены на 20%. При этом технология очистки на действующих сооружениях не может обеспечить соблюдение нормативных требований к составу сточных вод по большинству показателей.
В рамках федеральных программ с 2008 года администрацией города Благовещенска реализуются мероприятия по строительству второй нитки водопровода чистой воды от водозабора "Северный" до разводящей сети города и реконструкции очистных сооружений канализации. Реализация мероприятий осуществляется по мере поступления финансовых средств.