Краснодарский край имеет развитую информационно-коммуникационную систему при значительных проблемах инновационной экосистемы и низком уровне разработки и внедрения инноваций научными школами и бизнесом. Недостаточно внимания уделяется стимулированию создания и развития умной экономики. Низкий уровень конкурентоспособности инновационной системы - одна из ключевых проблемных зон.
Сегодня сильными сторонами инновационной сферы региона являются: высокое качество делового климата; наличие "сильных" вузов; высокий уровень подготовки кадров с современными производственными компетенциями; развитая инфраструктура сектора "связь и информация"; наличие современных промышленных предприятий, созданных с привлечением иностранных инвесторов, и предприятий, основанных в советский период, в сфере радиоэлектроники, авиаремонта, химической промышленности, станкостроения и так далее.
Ключевыми проблемами развития в инновационной сфере являются: низкий спрос на инновации со стороны государства и бизнеса; недостаточно развитый сектор исследований и разработок; низкий уровень внутренних затрат на исследования и разработки; слабо развитая инфраструктура поддержки инновационной деятельности; низкая эффективность "инновационного лифта"; низкая координация в реализации отдельных инновационных механизмов и программ, низкий уровень сетевого взаимодействия между участниками; дефицит инновационных предпринимателей; недостаточное качество системы подготовки и привлечения кадров для инновационной системы; финансирование поддержки инновационной деятельности из бюджета Краснодарского края (далее - краевой бюджет) по остаточному принципу; отсутствие региональных программ, а также конкурсов поддержки поисковых и прикладных исследований ученых региона; сохранение общей невосприимчивости экономики к инновациям, что препятствует практическому использованию (коммерциализации) результатов исследований и разработок ученых.