2.1. Формирование, координация и проведение государственной аграрной политики, направленной на развитие сельского хозяйства Магаданской области, создание благоприятных условий для его стабильного и эффективного функционирования.
2.2. Повышение конкурентоспособности агропромышленного комплекса, включая перерабатывающую и пищевую промышленность, и эффективности регулирования рынка сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия по основным видам продукции, сырья и продовольствия.
2.3. Улучшение инвестиционного и инновационного климата в агропромышленном комплексе области для развития предпринимательства, кооперации, агропромышленной интеграции, финансового оздоровления сельскохозяйственных товаропроизводителей.
2.4. Создание условий для рационального использования земель сельскохозяйственного назначения с учетом обеспечения плодородия земель сельскохозяйственного назначения.
2.5. Участие в разработке и реализации государственных программ Магаданской области по сферам деятельности, отнесенных к ведению Министерства.
2.6. Содействие проведению научно-технической политики и технической модернизации в агропромышленном комплексе.
2.7. Регулирование торговой деятельности в Магаданской области.
2.8. Осуществление лицензирования розничной продажи алкогольной продукции и розничной продажи алкогольной продукции при оказании услуг общественного питания на территории Магаданской области (за исключением розничной продажи вина, игристого вина (шампанского), осуществляемой сельскохозяйственными товаропроизводителями) и регионального государственного контроля (надзора) в области розничной продажи алкогольной и спиртосодержащей продукции.
2.9. Реализация полномочий в области ветеринарии, в том числе осуществление государственного регионального ветеринарного надзора.
2.10. Содействие развитию конкуренции на соответствующих товарных рынках.