Мероприятия подпрограмм государственной программы предусматривают комплекс взаимосвязанных мер, направленных на достижение целей государственной программы, а также на решение наиболее важных текущих и перспективных задач, обеспечивающих повышение уровня насыщения рынка региона доступными, безопасными и качественными продуктами питания местного производства, поступательное социально-экономическое развитие агропромышленного комплекса на основе его модернизации и перехода к инновационной модели функционирования в условиях расширения мирохозяйственных связей, устойчивое развитие сельских территорий и позитивное влияние на макроэкономические показатели области, а также максимально полное удовлетворение потребностей населения в товарах за счет обеспечения развития инфраструктуры отрасли.
Структурно государственная программа состоит из 21 подпрограммы:
1. Подпрограмма "Развитие подотрасли растениеводства, переработки и реализации продукции растениеводства на 2014-2016 годы".
2. Подпрограмма "Развитие подотрасли животноводства, переработки и реализации продукции животноводства на 2014-2016 годы".
3. Подпрограмма "Поддержка малых форм хозяйствования на 2014-2016 годы".
4. Подпрограмма "Техническая и технологическая модернизация, инновационное развитие на 2014-2016 годы".
5. Подпрограмма "Обеспечение реализации государственной программы развития сельского хозяйства Магаданской области на 2014-2018 годы".
6. Подпрограмма "Устойчивое развитие сельских территорий на 2014-2018 годы".
7. Подпрограмма "Развитие мелиорации земель сельскохозяйственного назначения Магаданской области на 2014-2018 годы".
8. Подпрограмма "Развитие мясного скотоводства на 2016 год".
9. Подпрограмма "Развитие овощеводства открытого и защищенного грунта и семенного картофеля на 2016 год".
10. Подпрограмма "Развитие молочного скотоводства на 2016 год".
11. Подпрограмма "Поддержка племенного дела, селекции и семеноводства на 2016 год".
12. Подпрограмма "Развитие торговли на территории Магаданской области на 2016-2018 годы".