Основными задачами Совета являются:
3.1. Рассмотрение вопросов, связанных с реализацией государственной национальной политики Российской Федерации, определение способов, форм и этапов ее реализации на территории Краснодарского края.
3.2. Подготовка предложений главе администрации (губернатору) Краснодарского края по реализации государственной национальной политики Российской Федерации в Краснодарском крае.
3.3. Координация действий органов государственной власти Краснодарского края и обеспечение взаимодействия с территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, органами местного самоуправления, национальными и религиозными объединениями, научными и другими организациями по вопросам сотрудничества в этноконфессиональной сфере, гармонизации межнациональных отношений.
3.4. Профилактика межнациональных и межрелигиозных конфликтов, обеспечение этноконфессионального согласия на территории Краснодарского края.
3.5. Выработка единых подходов к решению проблем в этноконфессиональной сфере, в вопросах гармонизации межнациональных отношений.
3.6. Содействие укреплению общественного согласия, достижению взаимопонимания и взаимного уважения в отношениях между представителями различных национальностей и конфессий.