Сложившаяся в республике экологическая обстановка во многом определяется ее ресурсно-промышленным потенциалом. Многие годы Башкортостан является одним из основных нефтедобывающих регионов России. На основе нефтедобычи получили развитие энергетика, нефтепереработка, химическая, газовая и нефтехимическая промышленность, нефтяное машиностроение.
Важными моментами в обеспечении эффективного выполнения природоохранных мероприятий являются рационализация и оптимальная организация системы соответствующего управления, включающей развитую систему мониторинга состояния окружающей среды, учет природных ресурсов и источников негативного воздействия на окружающую среду, программу экологического образования и воспитания населения.
Минерально-сырьевая база общераспространенных полезных ископаемых (далее - ОПИ) служит основой для развития промышленности строительных материалов, строительства автомобильных и железных дорог, аэропортов, трубопроводов, благоустройства населенных пунктов, берегоукрепления и многих других инженерных сооружений, необходимых для обеспечения жизнедеятельности предприятий и населения республики.
В Башкортостане имеется почти весь набор видов ОПИ, встречающийся в России. Территориальным балансом запасов в республике учтены 13 видов ОПИ: песчано-гравийная смесь и песок строительный, кирпично-черепичное сырье и строительные камни, гипс и ангидрит, агрохимическое сырье, торф и др. Запасы основных видов ОПИ в 2014 году составили 2119,5 млн. куб. м, в 2015 году - 2122,5 млн. куб. м.
Исходя из принципа неистощимого недропользования, запасы основных видов ОПИ от года к году не должны уменьшаться, а оставаться как минимум на уровне достигнутого. В связи с этим в 2018 - 2030 годы планируется поддерживать запасы основных видов ОПИ в объеме 2122,5 млн. куб. м.
В регионе насчитывается около 13 тыс. рек общей протяженностью свыше 57 тыс. км. Основную часть из них (99,9% по количеству и 87% по протяженности) составляют реки длиной менее 100 км. Объем средних ежегодно возобновляемых суммарных запасов поверхностных вод, формирующихся на территории республики, составляет 25,5 куб. км. С учетом вод, поступающих из соседних областей и Республики Татарстан, объем водных ресурсов возрастает до 35 куб. км. В целом Республика Башкортостан менее обеспечена водными ресурсами, чем Российская Федерация: на 1 человека в Башкортостане приходится 8750 куб. м воды в год, или 24 куб. м/сутки, против 29380 куб. м/год, или 80 куб. м/сутки, по России; в Пермской области, также входящей в бассейн Волги, этот показатель выше вдвое.
В последние десятилетия берега водных объектов республики испытывают все возрастающее воздействие негативных природных и техногенных процессов. Резко активизировалась абразия берегов, особенно на участках вблизи населенных пунктов, широкое развитие получили оползни, обвалы и осыпи. Размыву в паводковый период подвергаются участки береговых склонов, на которых расположены жилые дома и объекты социального назначения. Затопление территории не только влечет за собой большие экономические потери, но и может привести к гибели людей.
Протяженность берегов, подверженных негативному воздействию вод только в пределах населенных пунктов, - 1989,8 км.
В наибольшей степени эрозионные процессы характерны для рек, берущих свое начало с Бугульминско-Белебеевской возвышенности (реки Сюнь, Чермасан, Кармасан, левобережные притоки реки Демы) и с отрогов Общего Сырта (реки Дема, Уршак, Стерля, Ашкадар).
Общая площадь особо охраняемых природных территорий Республики Башкортостан (далее - ООПТ) составляет 947,3 тыс. га, или 6,6% от всей территории республики, которая благодаря своему географическому положению на стыке нескольких природных зон обладает значительным ландшафтным и биологическим разнообразием. Поэтому одним из приоритетных направлений природоохранной деятельности является развитие сети ООПТ как гаранта сохранения уникального биологического и ландшафтного разнообразия, популяций редких видов растений и животных. Кроме того, данная сеть может служить опорой для развития экологического туризма как одной из экономических отраслей региона.
В последние годы происходит уменьшение общей площади ООПТ. Это связано с приведением нормативных правовых актов Республики Башкортостан в соответствие с федеральным законодательством, проведением работ по инвентаризации ООПТ. В результате осуществления указанных работ были выявлены случаи накладки площадей друг на друга, то есть ранее были организованы памятники природы, затем они вошли в состав более крупных категорий ООПТ.
По результатам инвентаризации из состава ООПТ исключаются территории, утратившие по тем или иным причинам статус ООПТ, памятники природы и государственные природные заказники, которые расположены на территориях заповедников и национального парка федерального значения.
Одним из факторов, обеспечивающих разнообразие видов ихтиофауны республики, является богатство водных биологических ресурсов. Республика Башкортостан обладает значительным фондом рыбохозяйственных водоемов.
Однако в этой области имеется ряд проблем. Так, несмотря на наличие разнообразных водных ресурсов, наблюдается тенденция уменьшения используемых для промысловых целей водных акваторий. В первую очередь это связано с сокращением популяций ценных видов рыб (25% - 30%) в связи с вытеснением их из ареала распространения малоценными сорными видами (70% - 75%), не пользующимися спросом у населения. Многие акватории водоемов комплексного назначения республики не зарыблены.