4.1. Государственное управление и контроль в области организации, функционирования и использования уникального озера "Моготоево" осуществляет Министерство охраны природы Республики Саха (Якутия).
4.2. Обеспечение функционирования, оперативное управление уникальным озером "Моготоево" осуществляется государственным бюджетным учреждением Республики Саха (Якутия) "Дирекция биологических ресурсов и особо охраняемых природных территорий Министерства охраны природы Республики Саха (Якутия)".