Прекращение деятельности модельного центра осуществляется по следующим основаниям:
- окончание срока реализации приоритетного проекта, в рамках реализации которого осуществляет свою деятельность модельный центр;
- установление несоответствия деятельности, осуществляемой модельным центром, заявленной в отчетах о деятельности;
- ликвидация ГАУ ДПО СОИРО.