Амзинское сельское поселение: село Новая Амзя (административный центр), деревни Старая Русская Амзя, Старая Татарская Амзя, Черебатырево, поселок Кзыл Юл;
Андреевское сельское поселение: село Андреевка (административный центр), поселок имени III Съезда;
Ахметовское сельское поселение: деревня Ахметово (административный центр), село Аксумла, деревни Ерепкино, Осиновка, Чувашская Менча, поселки Чишма, железнодорожного разъезда Ахметово;
Бикуловское сельское поселение: деревня Бикулово (административный центр);
Биляр-Озерское сельское поселение: село Биляр-Озеро (административный центр), село Ерыкла;
Богдашкинское сельское поселение: село Русское Богдашкино (административный центр);
Бурметьевское сельское поселение: село Бурметьево (административный центр), село Курманаево, деревня Урняк;
Гайтанкинское сельское поселение: село Гайтанкино (административный центр), село Кривое Озеро, деревня Черное Озеро, поселок Старый Аул;
Егоркинское сельское поселение: село Егоркино (административный центр), деревни Единение, Караульная Гора, Русская Менча;
Елаурское сельское поселение: село Елаур (административный центр), село Кирпичное, деревни Берлек-Михайловка, Сосновка, поселки Петровский, Октябрина;
Зареченское сельское поселение: поселок Заречный (административный центр), деревня Турнояс, поселок Юган;
Кичкальнинское сельское поселение: село Кичкальня (административный центр);
Кульбаево-Марасинское сельское поселение: село Кульбаево-Мараса (административный центр), деревни Курнали-Амзя, Сельцо Кульбаево Мараса;
Мамыковское сельское поселение: село Мамыково (административный центр), поселок Бутаиха;