Большеатнинское сельское поселение: село Большая Атня (административный центр), деревни Малая Атня, Новая Юльба, Шеканясь;
Большеменгерское сельское поселение: село Большой Менгер (административный центр), деревни Бахтияр, Старый Менгер;
Верхнесердинское сельское поселение: село Верхняя Серда (административный центр);
Коморгузинское сельское поселение: село Коморгузя (административный центр), село Епанчино, деревни Марьян, Турукляр;
Кубянское сельское поселение: село Кубян (административный центр), село Каенсар, деревни Айшияз, Дусюм, Зильгильде, Нуртяк;
Кулле-Киминское сельское поселение: село Кулле-Кими (административный центр), село Ислейтар, деревни Бахтаче, Новая Береске;
Кунгерское сельское поселение: село Кунгер (административный центр), село Кошар, деревни Верхние Шаши, Мендюш, Нижние Шаши;
Кшкловское сельское поселение: село Кшклово (административный центр), деревни Кзыл-Утар, Новый Узюм;
Нижнеберескинское сельское поселение: село Нижняя Береске (административный центр), село Большие Берези, деревня Большая Шухата;
Нижнекуюкское сельское поселение: село Нижний Куюк (административный центр), села Атамыш, Верхний Куюк, деревни Новый Шимбер, Старый Шимбер;
Новошашинское сельское поселение: село Новые Шаши (административный центр), село Ключи-Сап, деревни Мамыш, Старый Югуп, Чембулат;
Узюмское сельское поселение: село Таш-Чишма (административный центр), деревни Мокша, Старый Узюм.