Граница начинается от точки, расположенной на административно-территориальной границе Республики Саха (Якутия) и Красноярского края в устье р. Биллях, граница идет в восточном направлении по берегу бухты Нордвик до устья р. Салга, затем по последней до устья р. Кургалах и вверх по ней до истока. Затем в южном направлении идет по суходолу и выходит к истоку р. Самаскаскай, далее вниз по р. Самаскаскай до ее устья, на берегу моря. Затем переходит водное пространство в общем юго-восточном направлении на мысе Хорго, далее в общем в восточном направлении по морскому берегу до устья безымянной речки, которая находится к северу от озера Булгунняхтаах. Отсюда в общем в южном направлении, потом огибает озеро Булгунняхтаах с западной стороны и выходит к устью безымянной речки и по последней до ее устья, далее граница идет по берегу до устья р. Чайдах-Юрях. С устья речки Чайдах-Юрях (впадающий в Оленекский залив моря Лаптевых) и вверх по течению до устья ее первого большого левого безымянного притока. Затем по безымянной речке до устья первого ее притока и по притоку до ее истока, далее через кряж и до верховья левого безымянного ручья, впадающего в реку Салга (правый приток р. Уэлэ). Оттуда по безымянной притоке, впадающей в р. Сасыл-Юрях до устья р. Сасыл-Юрях. Далее по р. Уэле до устья р. Кангаласс-Уэле, затем огибает с южной стороны озеро Куохуй-Лайдата, пересекает речки Тистях-Юряге, Кылай, Куччугуй Юрях, Куоча, Нангналах, Кумах Юрях. Затем вниз по Самахтах-Сяне до изгиба на запад и вниз по течению и до устья р. Уэлэ (впадающий в Анабарскую губу). Огибает губу с южной стороны и идет по левому берегу до устья р. Гуримискай. Далее от точки, находящейся в 5 км от устья р. Гуримискай (левый берег реки), далее к северо-востоку до отметки высоты N 51, затем на северо-запад по прямой, пересекающей верховья рек Кутуях-Салата, Самаскаскай, Иникян, Пани, Арангастах-Юрях, Биллях, Ластын-Юряге до точки, расположенной на северо-западе в 2,5 км от устья р. Тигян-Юрях и далее на юго-восток до устья р. Тигян-Юрях. Отсюда граница ресурсного резервата совпадает с административно-территориальной границей Республики Саха (Якутия) и Красноярского края.
Внутри описанной границы расположен Прончищевский участок N 3. Граница участка начинается с береговой линии моря Лаптевых, с точки координатами северная широта 73°39'59.65" и 73°39'56.44, восточная долгота 116°13'47.45" и 116°14'39.14", по территории резервата протяженностью 4 км, ширина 442 м. Далее поворачивает на запад, пересекая речки Лыгый Юрюе и Юнкюр, идет до водораздела р. Песчаная и безымянной речки, оттуда на юго-запад пересекает р. Юнюге с - Юрюя и прямо до р. Илья от истока 24 км. Далее прямой линией на юго-восток до отметки 153. Затем прямо на север до точки координат северная широта 73°29'00.50" восточная долгота 117°02'06.04" поворачивает на северо-запад до точки координат северная широта 73°36'18.74" восточная долгота 116°36'40.63", отсюда, пересекая р. Урасалах, идет к первоначальной точке.