Данный сегмент возобновляемых источников энергии при производстве электрической и тепловой энергии в качестве сырья использует биотопливо - топливо, получаемое из биологического сырья. По типу исходного сырья различают три вида биотоплива: биологические отходы, лигноцеллюлозные соединения и водоросли.
Из биотоплива первого поколения наиболее перспективным направлением является использование леса. Лесопромышленный комплекс занимает третье место в общем объеме экспорта из Вологодской области после металлургии и химической промышленности, поэтому использование древесных отходов в качестве топлива позволяет добиться существенного экономического эффекта.
Фактически на всех деревообрабатывающих предприятиях области установлены котельные на отходах лесопиления и деревообработки, позволяющие получать тепловую энергию, используемую для отопления производственных помещений и обслуживания сушильных камер. Наиболее крупные котлы-утилизаторы установлены на лесопильных производствах АО "Белозерский леспромхоз", АО "Череповецкий ФМК", АО "Сокольский ДОК", ООО "Премиумлес", ООО "Харовсклеспром", ООО "Новаторский ЛПК", АО "Великоустюгский ФК Новатор". В области также действуют пиролизные установки для получения древесного угля в Кадуе и Сямже, а на лесных предприятиях и некоторых сельхозпредприятиях идет апробация газогенераторных установок, работающих на древесном сырье.
Благоприятные условия для строительства мини-ТЭЦ на древесных отходах позволяют получать электрическую и тепловую энергию при утилизации отходов лесопромышленного комплекса. Целесообразность применения таких станций в отдаленных от центра районах, где наблюдается дефицит электроэнергии, подтверждается успешной работой АО "ТЭЦ "Белый Ручей" мощностью 6 МВт, использующего в качестве основного топлива отходы областных деревообрабатывающих предприятий. Для повышения надежности и эффективности работы станции ТЭЦ "Белый Ручей" предприятием в период 2019 - 2020 годов планируется строительство склада топлива.
Вторая мини-ТЭЦ на древесных отходах мощностью 3 МВт электрической энергии введена в работу в 2006 г. на АО "Великоустюгский фанерный комбинат "Новатор". Пуск мини-ТЭЦ позволил на 68% обеспечить производство собственной электрической энергией, обеспечить ежемесячную утилизацию около 7 тыс. плотных куб. м отходов деревообработки.
В области построено 22 предприятия по производству биотоплива общей производственной мощностью 138.6 тыс. тонн пеллет в год, перечень которых представлен в таблице 65.