1.1. Центры секвенирования для мониторинга изменчивости возбудителей инфекционных заболеваний (далее - Центры секвенирования) создаются на функциональной основе на базе подведомственных учреждений Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека.
1.2. Создание и ликвидация Центров секвенирования осуществляются в соответствии с приказом Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека.
1.3. Центры секвенирования в своей деятельности руководствуются Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, федеральными законами, актами Президента Российской Федерации, Правительства Российской Федерации, Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, а также настоящим Положением.
1.4. Центры секвенирования осуществляют свои функции при взаимодействии с медицинскими и научными организациями, а также органами и организациями Роспотребнадзора в субъектах Российской Федерации, включая Центры индикации возбудителей инфекционных болезней I-II групп патогенности и обеспечения противоэпидемической готовности, Опорные базы центров индикации возбудителей инфекционных болезней I-II групп патогенности, Научно-методические центры по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней II-IV групп патогенности, Референс-центры по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней, Центры лабораторной диагностики и научно-методическими центрами по отдельным направлениям деятельности с микроорганизмами, а также Центры верификации диагностической деятельности.
1.5. Основными направлениями деятельности Центров секвенирования являются обеспечение получения генетической информации с целью осуществления санитарно-эпидемиологического надзора на новом уровне с использованием мониторинга и прогнозирования эпидемиологической ситуации с помощью экспресс-генотипирования возбудителей инфекционных и паразитарных заболеваний, расшифровка структуры геномов возбудителей (вирусных, бактериальных, грибковых, паразитарных) инфекционных и паразитарных заболеваний (в т.ч. неясной этиологии), анализа генетической изменчивости патогенов с помощью современных методов высокопроизводительного секвенирования в специализированных структурных подразделениях учреждений Роспотребнадзора с последующим детальным биоинформатическим анализом получаемой геномной информации и размещением информации в национальной базе данных генетической информации VGARus.
1.6. Центры секвенирования предоставляют отчетность о своей деятельности в соответствии с запросами Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека.
1.7. Для получения статуса Центра секвенирования подведомственная организация Роспотребнадзора подает заявку руководителю Роспотребнадзора, которая содержит следующие сведения:
1.8. Подтверждение соответствия соискателем требованиям настоящего Положения, в том числе в части наличия необходимого оборудования, реагентов и квалифицированных специалистов;
1.9. Контакты лица, ответственного за размещение геномной информации в национальной базе данных VGARus и подачу отчетности по проведенному секвенированию;
1.10. Информацию о верификации (подтверждения) результатов секвенирования соискателя действующим Центром секвенирования;
1.11. Получив статус Центра секвенирования, подведомственная организация Роспотребнадзора подает заявку на подключение к национальной базе данных VGARus путем направления заявки в ФБУН "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Роспотребнадзора с указанием контактов лица, ответственного за размещение геномной информации в базе данных VGARus и подачу отчетности по проведенному секвенированию.