Средства на содержание палаты утверждаются в областном бюджете Новосибирской области отдельной строкой.
В целях обеспечения организационной и функциональной независимости финансирование палаты осуществляется на ее лицевой счет, открытый в управлении Федерального казначейства по Новосибирской области, в соответствии с утвержденной на текущий финансовый год сметой в полном объеме. Управление Федерального казначейства по Новосибирской области на договорной основе аккумулирует средства областного бюджета Новосибирской области на лицевом счете органа, исполняющего областной бюджет Новосибирской области, для финансирования палаты, и осуществляет контроль за целевым использованием аккумулированных средств.