Текущее управление за реализацией программы осуществляет государственный заказчик.
Государственный заказчик, с учетом выделяемых на реализацию программы финансовых средств ежегодно, уточняет целевые показатели и затраты по программным мероприятиям, механизм реализации программы, состав исполнителей.
Департамент здравоохранения Новосибирской области ежеквартально, до 20 числа месяца, следующего за окончанием квартала, представляет в департамент экономики и планирования администрации Новосибирской области информацию о ходе исполнения Программы.(Абзац в редакции, введенной постановлением сорок четвёртой сессии Новосибирского областного Совета депутатов третьего созыва от 08.09.05, - см. предыдущую редакцию)