Разделение Государственной программы на подпрограммы осуществлялось по территориальному и отраслевому признакам (принадлежности объектов органам исполнительной власти города Москвы). При этом все подпрограммы (приложение 1 к Государственной программе) предусматривают мероприятия, направленные на создание необходимых условий для обеспечения перехода на энергоэффективный путь развития экономики.
Основной целью подпрограмм Государственной программы является сокращение потребления топливно-энергетических ресурсов не менее чем на 3% ежегодно в течение 5 лет за счет привлечения инвестиций.
Каждая из подпрограмм Государственной программы предусматривает выполнение требований Федерального закона Российской Федерации от 23 ноября 2009 года N 261-ФЗ "Об энергосбережении и о повышении энергетической эффективности и о внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации" по снижению организациями, подведомственными органам исполнительной власти города Москвы, удельных показателей потребления электрической и тепловой энергии, воды и природного газа и сокращению потерь энергоресурсов.
В подпрограммы включены мероприятия, направленные на энергосбережение и энергоэффективность.