4.1. Председателем Совета является заместитель Мэра Москвы в Правительстве Москвы по вопросам экономической политики.
4.2. Состав Совета формируется председателем Совета из числа представителей федеральных органов исполнительной власти (по согласованию), органов исполнительной власти субъектов Российской Федерации, российских и международных экспертов в области инновационной деятельности.
4.3. Председатель Совета утверждает перечень рабочих групп по направлениям деятельности Совета, порядок их работы и руководителей.
4.4. Ответственным секретарем Совета является представитель Департамента науки, промышленной политики и предпринимательства города Москвы в должности не ниже заместителя руководителя.