Границы заказника проходят:
от границы пересечения пр.пр.634 с Никулинской ул., 400 м на северо-восток по Никулинской ул. до границ земельного участка АЗС "Синтез Петролеум", далее 100 м по границе земельного участка АЗС "Синтез Петролеум" и 147 м на юго-восток по Никулинской ул. Далее на юг по границе прибрежной защитной полосы р.Очаковки до границ земельного участка ГСК "Треугольник", далее на юг по границам земельных участков ГСК "Треугольник", автостоянки N 401 МГСА, ООО "Стеди" до пересечения с Тропаревской ул. Далее на юго-восток до земельного участка жилого дома и линии застройки до пересечения с ул.Академика Анохина. Далее 115 м на юг по нечетной стороне ул.Академика Анохина до земельного участка строящегося жилого квартала и 650 м по границе жилой застройки до пересечения с ул.Академика Анохина. Далее 442 м на север по нечетной стороне ул.Академика Анохина до Ленинского проспекта. Далее 340 м на юго-запад по красной линии Ленинского проспекта и 373 м на запад до пересечения с МКАД и 1760 м на северо-запад по внутренней стороне Московской кольцевой автодороги до пересечения с пр.пр.634. Далее 694 м на северо-восток вдоль пр.пр.634 до пересечения с границей ГУ "Специализированный лесхоз "Экспериментальный Москворецкий". Далее 247 м на юго-восток по границе ГУ "Специализированный лесхоз "Экспериментальный Москворецкий" и 299 м на восток до границы водоохранной зоны р.Очаковки и по ней 548 м на северо-восток и 546 м на северо-запад до пересечения с технической зоной. Далее 209 м на запад по внутренней границе технической зоны до пересечения с пр.пр.634. Далее 177 м на северо-запад по границе пр.пр. 634 до пересечения с Никулинской ул.
Северный участок по четной стороне ул.Академика Анохина: на северо-западе, севере: от точки пересечения береговой линии пруда с левой стороной прогулочной дорожки; далее по прямой, продолжающей левую сторону прогулочной дорожки, до пересечения с бровкой склона береговой линии пруда; далее на восток 114,6 м по бровке склона береговой линии; далее на северо-восток до пересечения с береговой линией пруда; на востоке, юго-востоке и юге: от пересечения береговой линии пруда с бровкой склона на юго-восток, юго-запад до пересечения с северной стороной проезда внутреннего пользования; далее на северо-запад по проезду до пересечения с установленной береговой линией пруда; на юго-западе, западе: от пересечения северной стороны проезда с береговой линией пруда на северо-запад, северо-восток и восток до точки пересечения левой стороны прогулочной дорожки с береговой линией пруда.
Южный участок по четной стороне ул.Академика Анохина: 148 м на север по четной стороне ул.Академика Анохина до границы земельного участка Военной академии Генерального штаба Вооруженных сил РФ. Далее 64 м на восток, 74 м на северо-восток, 101 м на север и 314 м на юго-восток до пересечения с красной линией ул.Рузская, далее на юго-запад 408 м по прямой до пересечения с красной линией пр.пр. N 436 и 165 м на северо-запад до пересечения с ул.Академика Анохина.
В границы особо охраняемой природной территории регионального значения "Ландшафтный заказник "Тропаревский" не входит территория специального объекта Министерства обороны Российской Федерации (объект природного комплекса N 147 Западного административного округа города Москвы).