Общий контроль за выполнением Программы осуществляет первый вице-губернатор Ленинградской области.
Контроль за выполнением мероприятий Программы и целевым использованием финансовых средств осуществляет комитет по местному самоуправлению, межнациональным и межконфессиональным отношениям Ленинградской области.
Контроль за финансированием мероприятий Программы осуществляет комитет финансов Ленинградской области.
Комитет по местному самоуправлению, межнациональным и межконфессиональным отношениям Ленинградской области представляет ежеквартально информацию о ходе финансирования и выполнения мероприятий Программы в Комитет экономического развития и инвестиционной деятельности Ленинградской области и ежегодно - доклад в Правительство Ленинградской области.