Ежегодное увеличение автотранспорта на городских дорогах негативным образом влияет на экологическую ситуацию в городе, особенно в зоне жилой застройки, расположенной вблизи улиц с наиболее интенсивным движением. Муниципальное образование город Краснодар включено в единую территориальную систему экологического мониторинга Краснодарского края с 2009 года.
На сегодняшний день в систему экологического мониторинга города входят четыре стационарных поста контроля уровня загрязнения атмосферного воздуха (ПКЗ) и одна передвижная экологическая лаборатория для измерения уровня загрязнения атмосферного воздуха (ПЭЛ).
За 2016 год на территории муниципального образования город Краснодар с помощью ПКЗ было проведено 614618 сессий измерений состояния атмосферного воздуха, из них зарегистрировано 618 (0,11% от общего числа) превышений предельно допустимой концентрации наблюдаемых веществ, из них по веществам, входящим в состав выбросов от автотранспорта: 5 (0,81%) - оксида азота, 2 (0,33%) - диоксида азота, 28 (4,54%) - оксида углерода.
За истекший период в 2017 году, с 01.01.2017 по 31.07.2017, на территории муниципального образования город Краснодар с помощью ПКЗ было проведено 520986 сессий измерений состояния атмосферного воздуха, из них зарегистрировано 297 (0,05% от общего числа) превышений предельно допустимой концентрации наблюдаемых веществ, из них по веществам, входящим в состав выбросов от автотранспорта: 9 (3,03%) - оксида азота, 14 (4,72%) - оксида углерода.
По информации Управления Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Краснодарскому краю мониторинг физических факторов на территории муниципального образования город Краснодар в 2016 году проводился в 5 точках лабораторией ФБУЗ "Центр гигиены и эпидемиологии в Краснодарском крае", из них шумового загрязнения - в 4 точках, расположенных в селитебной зоне, - в зоне влияния автотранспорта. В течение 2017 года в мониторинговых точках произведено 32 замера уровня шума. В 32 случаях выявлены превышения предельно-допустимых уровней (ПДУ) шума. Превышение ПДУ шума отмечается от транспортного потока по основным автомагистралям города (ул. Красной, ул. Ставропольской, ул. Северной, ул. Красных Партизан).