Охранная зона памятника природы озера Карачура расположена на территории Нагайбакского муниципального района.
Граница охранной зоны памятника природы озера Карачура определена расстоянием от границы памятника природы озера Карачура не менее 100 м и колеблется от 100 до 600 м.
Общая протяженность границы охранной зоны памятника природы озера Карачура составляет 6,70 км. Площадь охранной зоны памятника природы озера Карачура составляет 130,12 га.