Основными задачами Заказника являются:
- поддержание целостности естественных природных сообществ;
- охрана мест гнездования, массового скопления и отдыха во время перелета водоплавающих и других перелетных птиц;
- сохранение и воспроизводство редких и исчезающих видов животных, занесенных в Красные книги Российской Федерации и Сахалинской области, и мест их обитания, таких как: росомаха, каменный глухарь, орлан белоплечий, орлан-белохвост, сапсан, кречет, малый (тундровый) лебедь, черная кряква, большая, средняя и малая белая цапли, мандаринка, сухонос и другие;
- сохранение и воспроизводство ценных в хозяйственном, научном и культурном отношении видов зверей и птиц: бурого медведя, дикого северного оленя, выдры, соболя, американской норки, лисицы, рябчика и других;
- охрана среды мест обитания и путей миграций ценных охотничьих зверей и птиц;
- охрана и сохранение в естественном состоянии водно-болотных угодий и тундровых ландшафтов.