Наряду с достигнутыми позитивными результатами в промышленном секторе остаются ограничения развития и проблемы долговременного характера, в том числе:
- недостаточно диверсифицированная структура экономики, преобладание в общем объеме промышленного производства объема продукции (работ, услуг) сектора добывающих производств (добычи полезных ископаемых и непосредственно связанных с ними производств) и незначительное развитие обрабатывающих производств;
- устаревшие основные фонды предприятий, доля которых составляет в добыче полезных ископаемых, кроме топливно-энергетических, - 58,1%, в обрабатывающих производствах – 42,4%, в производстве нефтепродуктов – 49,1%, в производстве и распределении электроэнергии, газа и воды - 51,7%.
Высокий уровень износа основных фондов требует активизации инвестиционных процессов по их обновлению и модернизации. В противном случае, сохранение и тем более наращивание объемов промышленного производства будет весьма затруднительным;
- низкая инвестиционная активность на уровне отдельной организации или предприятия, которая оказывает негативное влияние на эффективность производственных процессов, приводит к неэффективному использованию трудовых ресурсов и негативно сказывается на конкурентоспособности производства и продукции;
- кадровая проблема, проявляющаяся в дефиците высококвалифицированных специалистов, управленческих кадров, основных и вспомогательных рабочих по всем технологическим направлениям. По-прежнему низким остается уровень подготовки выпускников учреждений высшего, среднего и начального профессионального образования ввиду их недостаточной практической подготовки на современном оборудовании, незнания передовых технологий, падения престижа инженерно-технических специальностей и рабочих профессий;
- рост цен на услуги естественных монополий и увеличение себестоимости продукции вследствие роста затрат на энергоресурсы. В структуре себестоимости субъектов промышленной деятельности доля затрат на электроэнергию достигает, в среднем, 12%, а на отдельных производствах - до 40%.