1. Основными задачами главного управления являются:
1) обеспечение стабильного развития агропромышленного комплекса края и увеличение объемов производства продукции и услуг, создание необходимых организационно-экономических, правовых и социальных условий для повышения эффективности работы организаций всех форм собственности и хозяйствования;
2) обеспечение государственной поддержки товаропроизводителей агропромышленного комплекса, исходя из объемов ассигнований на его развитие, предусмотренных федеральным и региональным бюджетами; осуществление краевой инвестиционной политики в сфере агропромышленного комплекса;
3) формирование приоритетных направлений развития аграрной науки и техники, новых методов хозяйствования, инновационной деятельности; организация информационно-консультационной службы, как одного из наиболее эффективных механизмов реформирования агропромышленного комплекса края;
4) определение основных направлений кадровой политики, в том числе по повышению профессиональной подготовки и квалификации руководителей и специалистов организаций агропромышленного комплекса края;
5) осуществление целенаправленной региональной аграрной политики в соответствии с федеральным и краевым законодательством, в том числе по регулированию производства и реализации сельскохозяйственной продукции, производственно-техническому обслуживанию, материально-техническому обеспечению агропромышленного производства в крае и социальному развитию села;
6) формирование целевых программ продовольственной безопасности, страховых фондов, новых форм защиты сельскохозяйственного производства от чрезвычайных ситуаций;
7) осуществление государственной политики в сфере развития кооперации, агропромышленной интеграции, обеспечения защиты интересов сельскохозяйственных товаропроизводителей, эффективного воздействия ее на продовольственный рынок с учетом региональных особенностей;
8) планирование и прогнозирование использования сельскохозяйственных ресурсов и развития агропромышленного производства в крае с разработкой и реализацией программ, проектов, концепций;
9) совершенствование системы управления агропромышленным комплексом края и взаимоотношений между главным управлением и органами местного самоуправления по вопросам функционирования агропромышленного комплекса края путем разработки совместных программ, концепций, заключения соглашений;
10) проведение совместно с Минсельхозом России в Алтайском крае государственной политики в области мелиорации земель через специально уполномоченный территориальный орган Минсельхоза России - Управление "Алтайводмелиорация";
11) организация содействия Алтайскому территориальному органу Минсельхоза России по охране, контролю и регулированию использования охотничьих животных в выполнении задач по охране, воспроизводству и регулированию использования охотничьих животных и среды их обитания, Алтайской краевой государственной инспекции по охране и воспроизводству рыбных запасов и регулированию рыболовства Минсельхоза России, Государственному центру агрохимической службы "Алтайский" Минсельхоза России и другим федеральным и региональным органам, учреждениям.