Согласно Перечню лесорастительных зон и лесных районов Российской Федерации, леса на территории Фрунзенского лесничества относятся к Алтае-Саянскому горно-таежному району Южно-Сибирской горной зоны и к Западно-Сибирскому подтаежно-лесостепному району Лесостепной зоны (таблица 1.1.3).